中药及其製剂均為多组分复杂体系，因此评价其质量应採用与之相适应的，能提供丰富鉴别信息的检测方法，但现行的显微鉴别、理化鉴别和含量测定等方法都不足 以解决这一问题，建立中药指纹图谱将能较為全面地反映中药及其製剂中所含化学成分的种类与数量，进而对药品质量进行整体描述和评价。这也正好符合中医药整体学说。而採用中药指纹图谱的方式，能标示出中药的质量，就如為中药和中药產品贴上"化学条码"标签，建立了独有的质量控製标準。如此一来，就能进一步确保每批中药產品质量如一，让顾客对中药更具信心。在此基础上，如果进一步开展谱效学研究，可使中药质量与其药效真正结合起来，有助於阐明中药作用机理。总之，中药指纹图谱的研究和建立，对於提高 中药质量，促进中药现代化具有重要意义。

目前，中药指纹图谱技术已涉及眾多方法，包括薄层扫描（TLCS）、高效液相色谱法（HPLC）、气相色谱法（GC）和高效毛细管电泳法（HPCE）等色谱法以及紫外光谱法（UV）、红外光谱法（IR）、质谱法（MS）、核磁共振法（NMR）和X—射线衍射法等光谱法。其中色谱方法為主流方法，尤其是HPLC、TLCS和GC已成為公认的三种常规分析手段。由於HPLC具有分离效能高、选择性高、检测灵敏度高、分析速度快、应用范围广等特点；中药成分绝大多数可在高效液相色谱仪上进行分析检测，且积累较丰富的应用经验。因此高效液相色谱法已成為中药指纹图谱技术的首选方法。随著HPLC— MS和GC—MS等联用技术的应用，中药指纹图谱技术更趋完善。